jsWaffleでjQueryを使う方法
「jsWaffleを手動でインストールする方法」で紹介した手順でjsWaffleのインストールを完了したら、プロジェクトのassetsフォルダの中のwwwフォルダにscriptフォルダなんかを作って下さい。
別にフォルダは作らなくてもいいのですが、一応お決まりとしてそうしておきましょう。
その中にjQuery.jsを入れて、さらに操作用のscript.jsなんかを作って入れておきます。
あとはwwwフォルダのindex.htmlとかそこからリンクしたHTMLファイルに以下のような普通の方法で読み込んで置けば普通に使えます。
<script type="text/javascript" src="script/jquery.js"></script> <script type="text/javascript" src="script/script.js"></script>
その他のライブラリについてもこんな感じでたぶん使えると思います。
jsWaffle.jsとぶつからないように注意しましょう。